Contig
ストックにはログインが必要です
エージェント型バイオインフォマティクス:実行・自己修復・検証を行う
Artificial Intelligence
Developer Tools
GitHub
Science
製品概要
- 自分の計算資源上で適切なパイプラインを実行
- 自動自己修復(OOM、欠損インデックス、バージョン不一致)と修復チェーンの可視化
- 実QCチェックで検証し、PASS/WARN/FAIL/UNVERIFIED の verdict を返す
- 署名付き・再現可能な記録を出力
- CLI + ローカルダッシュボード
実装と対応状況
- Apache-2.0で自ホスト可能
- nf-core/rnaseq で end-to-end 動作を検証済み
- scRNA-seq、遺伝子型+体細胞変異、メチル化、16S、メタゲノミクスなど6アッセイにQCパックを準備中
- ダッシュボードは現状 localhost 専用、プレ収益
試用方法
- pipx install contig
- contig run --run-id smoke
- contig show smoke
要望
- 壊れたケースを報告してください。回収された障害はデータポイントとして検出器を改善します
投票数: 2